COVID-19 recurrence: spotlight on another pandemic issue
Pr Ahmed Ben SAAD

Since December 2019, the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has become the main health concern throughout the world.
It is continuing to cause substantial loss of life and economic damage globally. It has presented multiple diagnostic and therapeutic challenges for the clinician. COVID-19 was expected to be an immunizing disease. However, there is currently a rising concern about COVID-19 recurrence. In fact, several studies reported a second clinically- and virologically confirmed acute COVID-19 episode after recovery. Indeed, up to 14% of patients clinically recovered from COVID-19 infection had re-positive reverse-transcriptase polymerase-chain-reaction (RT-PCR) at nasopharyngeal swab during follow-up according to some published data. In line with this fact, the duration of immunization after clinical recovery is still unknown. Immunity to SARS-CoV-2 involves both cell-mediated and humoral responses with an uncertain definitive viral clearance. Another troubling fact is that reinfection with positive RNA tests may occur despite seropositivity for IgG.
The COVID-19 recurrence is one of the major ongoing debates of the pandemic generating several hypotheses: true reinfection, persistent low-level infection, reactivation, or inflammatory rebound...? Understanding this condition is of particular interest regarding the management and spread of the infection.

Infection COVID 19 en Tunisie, dans quelle mesure devrions-nous nous inquiéter ?
Dr Zouhair SOUISSI

En Tunisie, depuis le début de la pandémie de COVID-19, 3 572 cas positifs ont été confirmés sur 139 527 cas testés avec une moyenne actuelle de 96 nouveaux cas quotidiens causant la mort de 76 cas. Mi-mars, la situation est devenue épidémique, ce qui a conduit le gouvernement à décréter le verrouillage général le 20 mars.
Cette mesure radicale a brisé les chaînes de transmission, limitant le flux du virus et «réinitialisé» l'épidémie.
Avec l'été, les cas positifs ont à nouveau augmenté : depuis la mi-juillet, et de façon sensible à partir du 10 août, nous avons dès lors observé une augmentation des cas positifs confirmés quotidiennement à 1792 nouveaux cas entre le 10 et le 27 août, soit la moitié de tous les cas en 2 semaines seulement.
Cela n'a pas beaucoup de sens de comparer ces chiffres avec les chiffres de mars, car la situation est très différente en ce qui concerne les tests. À l'époque, seuls les patients présentant des symptômes sévères étaient dépistés, ce qui n'est plus le cas.

Au printemps, le nombre de cas réels était donc beaucoup plus élevé que ceux enregistrés et c’est pratiquement le cas en France et dans une grande partie de pays ayant opté pour un dépistage ciblé.  Bien que la situation se soit améliorée aujourd'hui, il est encore difficile de savoir à quel point l'épidémie est sous-estimée. Une chose est sûre : le nombre de cas augmente plus que le nombre de tests.
L'immunité collective, qui ralentirait la circulation du virus, sera très difficile à réaliser, en effet dans une population où le virus circule de manière égale, il faut 60 à 70% des personnes pour être infectées et développer des anticorps neutralisants pour atteindre l'immunité collective. Il serait dangereux de laisser le virus circuler dans certains groupes, comme les jeunes, dans l'espoir d'obtenir plus rapidement l'immunité collective.
Les populations ne sont pas séparées les unes des autres : si l'épidémie se propage dans un groupe, d'autres seront progressivement affectés, en effet ceci a été constaté en Floride où pendant deux à trois semaines, le nombre de cas diagnostiqués a augmenté principalement chez les jeunes, les hospitalisations et les besoins en soins intensifs ont augmenté secondairement trois à six semaines plus tard.
Une chose est sure, il ne faut pas sous-estimer la gravité de cette épidémie, les chiffres d’hospitalisation et de mortalité ne bougeront que si les populations vulnérables soient concernés par l’infection car en ce moment ce sont les jeunes et les patients asymptomatiques qui sont actuellement concernés, la reprise de l’année scolaire, le changement de saison et la résurgence des viroses, la tendance vers des rassemblements en espaces clos facilitant le contact direct entre populations vulnérables tels que les personnes âgées et des enfants porteurs potentiels de virus. Cette situation doit nous amener à être préparés pour ne pas perdre le contrôle de l'épidémie.
En attendant un vrai traitement ou un vaccin, le seul moyen d'éviter une épidémie galopante est donc de gérer la circulation du virus à un niveau acceptable, en utilisant un dépistage et un suivi généralisé et rapide des contacts, ainsi que le respect des mesures de distanciation sociale dans la mesure du possible et la compliance de la population.
Cet équilibre n'est pas facile à maintenir, mais c'est notre seule option pour les mois à venir.

Misconceptions about weather and seasonality must not misguide COVID-19 response
Les idées fausses sur la météo et la saisonnalité ne doivent pas tromper la réponse au COVID-19 
Colin J. Carlson et al.. Nature Communications volume 11, Article number: 4312 (2020)

Les conditions météorologiques peuvent affecter marginalement la dynamique du COVID-19, mais les idées fausses sur la façon dont le climat et les conditions météorologiques entraînent l'exposition et la transmission ont influencé négativement les perceptions des risques pour les décideurs et les citoyens.
Les futurs travaux scientifiques sur ce sujet politiquement chargé nécessitent une approche plus prudente.
Depuis les premières semaines de la pandémie, une grande attention scientifique et publique s'est concentrée sur la manière dont le temps pourrait réduire ou modifier la transmission du COVID-19.
Que ce soit en raison de l'attention scientifique croissante accordée au changement climatique et à la santé ou simplement parce que le nouveau virus pandémique nous a obligés à nous tourner vers d'autres maladies pour trouver des idées, beaucoup pensaient - sinon carrément espérer - que le SRAS-CoV-2 pourrait montrer une sensibilité environnementale qui freinerait risque d’épidémie d’une manière ou d’une autre.
Désormais, il est urgent de clarifier et d'affiner ces attentes avec les preuves disponibles, en particulier en ce qui concerne la manière dont les scientifiques communiquent avec les décideurs et le public.
Cet article offre une analyse pertinente sur le sujet en expliquant comment et pourquoi les conditions météorologiques pourraient affecter la transmission du COVID-19 et comment les hypothèses émises sont devenues une politique de santé.

Quatre scénarios sur la façon dont nous pourrions développer l'immunité contre Covid-19
Helen Branswell. Statnews.  Publié en ligne le 25 août 2020. 

Alors que le monde se lasse d'essayer d'éradiquer le virus SRAS-CoV-2, beaucoup d'entre nous se demandent à quoi ressemblera l'avenir alors que nous essayons d'apprendre à vivre avec.
Aura-t-il toujours la capacité de nous rendre si malades? Nos systèmes immunitaires apprendront-ils et se souviendront-ils ? comment faire face à la nouvelle menace? et est ce que des vaccins seront-ils protecteurs et durables?
Ces questions pressantes sont devenues encore plus urgentes avec la récente nouvelle que des scientifiques de Hong Kong ont confirmé qu'un homme de 33 ans avait été réinfecté par Covid-19; sa deuxième infection diagnostiquée par dépistage à l'aéroport est survenue 4,5 mois après sa première infection en mars.

Comment obtenir un échantillon sur écouvillon nasopharyngé

New England Journal of Medicine Videos
Francisco M. Marty, M.D., Kaiwen Chen, B.S., and Kelly A. Verrill, R.N.

Durée de l'infectivité du SRAS-CoV-2 : quand est-il prudent d'arrêter l'isolement?  

Chanu Rhee et al. Clinical Infectious Diseases, Publié en ligne le 25 août 2020. 

La définition de la durée de l'infectiosité du SRAS-CoV-2 a des implications majeures pour la santé publique et les pratiques de contrôle des infections dans les établissements de santé.
Au début de la pandémie, la plupart des hôpitaux ont exigé deux tests RT-PCR négatifs avant d'interrompre l'isolement des patients atteints de Covid-19. Cependant, de nombreux patients ont des tests de RT-PCR positifs de manière persistante pendant des semaines à des mois après la guérison clinique et de multiples études indiquent maintenant que les RT-PCR toujours positifs ne reflètent généralement pas le virus capable de se répliquer.
Le SRAS-CoV-2 semble être le plus contagieux au moment de l'apparition des symptômes et l'infectiosité diminue rapidement par la suite pour atteindre près de zéro après environ 10 jours chez les patients légèrement à modérément malades et 15 jours chez les patients gravement gravement malades et immunodéprimés.
L'intervalle le plus long associé à un virus capable de se répliquer jusqu'à présent est de 20 jours à compter de l'apparition des symptômes.

Cette revue résume les données probantes à ce jour sur la durée de l'infectiosité du SRAS-CoV-2 et comment cela a éclairé les recommandations de santé publique en évolution sur le moment où il est sécuritaire d'interrompre les précautions d'isolement.

Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.

The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.