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19 Juillet 2020

Comment l'Afrique a elle géré l'infection par le Covid-19?
BMJ 2020; 370, publié le 16 Juillet 2020. Bibi-Aisha Wadvalla

Cinq mois après sa première infection au covid-19, l'Afrique semble avoir été épargnée par le poids de la pandémie. Mais avec des systèmes de santé faibles, les stratégies sont alimentées par une vigilance et une peur constantes. Il a fallu 90 jours à l'Afrique, avec 54 pays, pour atteindre 100 000 cas, mais 19 jours de plus pour doubler à 200 000 cas, et 12 jours supplémentaires pour atteindre 300 000. Le 8 juillet, il est passé à 500 000 et 12 000 décès .
Bien que le nombre de cas sur le continent augmente rapidement à une moyenne de 11 000 par jour, les chiffres démentent une histoire d'anxiété continue mais aussi de soulagement. L'Organisation mondiale de la santé affirme que les cas ont plus que doublé dans 22 pays de la région au cours du dernier mois, mais que le nombre de cas est inférieur aux prévisions et rien n'indique que des infections graves et des décès soient omis. L’Algérie, l’Égypte, le Ghana, le Nigéria et l’Afrique du Sud représentent 71% des cas de covid-19, l’Afrique du Sud représentant à elle seule 43% du total des cas du continent. 
L'Afrique du Nord a été la première région du continent à être touchée par le covid-19. L'Égypte et l'Algérie ont connu une forte augmentation des cas, tandis que la Tunisie et le Maroc ont contenu la propagation du virus grâce à des mesures précoces, notamment l'isolement des cas et les ordonnances de rester à domicile.  La Tunisie a ouvert ses frontières le 27 juin. Les voyageurs originaires de pays à faible prévalence du SRAS-CoV-2 peuvent entrer sans restriction, tandis que les voyageurs des pays à prévalence moyenne doivent subir un test négatif trois jours avant le voyage. ...

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Risque de transmission du SRAS-CoV-2 par les aérosols, utilisation rationnelle des masques et protection des travailleurs de la santé
Antimicrobial Resistance and Infection Control (2020) 9:100. Sommersteinet al.

Le SARS-CoV-2, est considéré comme transmis par des gouttelettes plutôt que par des aérosols, mais les gouttelettes avec un fort soutien directionnel du flux d'air peuvent se propager sur plus de 2 m.
Des taux élevés d'infections au COVID-19 chez les travailleurs de la santé ont été signalés dans plusieurs pays. Les masques à pièce faciale filtrante (FFP) 2 ont été conçus pour protéger les travailleurs de la santé, tandis que les masques chirurgicaux étaient à l'origine destinés à protéger les patients.
Néanmoins, les masques chirurgicaux standard de haute qualité (type II / IIR selon la norme européenne EN 14683) semblent être aussi efficaces que les masques FFP2 pour prévenir les infections virales associées aux gouttelettes des travailleurs de la santé signalées par la grippe ou le SRAS.
Jusqu'à présent, aucun essai en tête-à-tête avec ces masques n'a été publié pour COVID-19. Aucun des deux types de masque n'empêche complètement la transmission, ce qui peut être dû à une manipulation inappropriée et à d'autres voies de transmission. Par conséquent, le respect d'un ensemble de mesures de contrôle des infections, y compris une hygiène des mains approfondie, est essentiel. Pendant les procédures à haut risque, des gouttelettes et des aérosols peuvent être produits, raison pour laquelle les masques à pièce faciale filtrante (FFP)sont indiqués pour ces interventions.

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Dans quelle mesure un vaccin contre le coronavirus COVID-19 doit-il être efficace pour arrêter la pandémie? 
The Conversation 
Bruce Y. Lee Professor of Health Policy and Management, City University of New York

Le monde place ses espoirs dans un vaccin contre le coronavirus COVID-19, mais un vaccin suffira-t-il à lui seul pour arrêter la pandémie et permettre à la vie de revenir à la normale?
La réponse dépend de la «qualité» du vaccin. Dans une étude publiée le 15 juillet dans l'American Journal of Preventive Medicine, selon une simulation informatique l’efficacité d’un vaccin contre les coronavirus doit être supérieure à 70%, voire 80%.
En comparaison, le vaccin contre la rougeole a une efficacité de 95% à 98% et le vaccin contre la grippe est de 20% à 60%. Cela ne veut pas dire qu’un vaccin offrant moins de protection serait inutile, mais cela signifierait qu’une distanciation sociale sous une forme ou une autre serait encore nécessaire.
Certains dirigeants politiques ont suggéré que la société reviendrait à la normale bientôt, en particulier si un vaccin devenait disponible d'ici la fin de l'année ou au début de 2021. Certains vaccins sont actuellement en phase d'essai, mais ce calendrier serait encore très optimiste.  La différence entre efficacité et efficience réside dans le fait que est que la première s'applique lorsque la vaccination est administrée dans des circonstances contrôlées, comme un essai clinique, et que la seconde est dans des conditions «réelles». En règle générale, l'efficience d’un vaccin a tendance à être inférieure à son efficacité. ...

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Traitement par hydroxychloroquine, azithromycine et association chez les patients hospitalisés avec COVID-19 
S. Arshad et al. / International Journal of Infectious Diseases 97 (2020) VOLUME 97, P396-403, AUGUST 01, 2020

Il s'agit d'une étude observationnelle rétrospective multicentrique incluant 2 541 patients de la ville de Detroit, Michigan,
Résultats :  La durée d'hospitalisation totale médiane était de 6 jours (IQR: 4–10 jours), l'âge médian était de 64 ans (IQR: 53–76 ans), 51% d'hommes, 56% afro-américains, avec une durée médiane au suivi de 28,5 jours (IQR: 3–53). La mortalité globale à l'hôpital était de 18,1% ; par traitement: hydroxychloroquine + azithromycine, 157/783 (20,1%), hydroxychloroquine seule, 162/1202 (13,5%), azithromycine seule, 33 / 147 (22,4%), et aucun des deux médicaments, 108/409 (26,4%). La principale cause de mortalité était l'insuffisance respiratoire (88%); aucun patient n'avait de torsades de pointes documentées.
D'après la modélisation de régression de Cox, les prédicteurs de mortalité étaient l'âge> 65 ans, la race blanche, l'IRC, la réduction du niveau de saturation en O2 à l'admission et la mise sous respirateur à l'admission.
L'hydroxychloroquine a permis de réduire le risque de 66% et l'hydroxychloroquine + azithromycine de 71% par rapport à aucun des deux traitements (p <0,001).
Conclusions et pertinence : Dans cette évaluation multihospitalière, lors du contrôle des facteurs de risque de COVID-19, le traitement par hydroxychloroquine seule et en association avec l'azithromycine a été associé à une réduction de la mortalité associée au COVID-19. Des essais prospectifs sont nécessaires pour examiner cet impact

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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12 Juillet 2020

 
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Vulnérabilité biologique et risque de mortalité par l’infection COVID-19
Dr Zouhair SOUISSI

Depuis l'émergence de la maladie des coronavirus-19 (COVID-19) vers la fin de 2019, la maladie a attiré une attention mondiale extraordinaire en raison de l’augmentation exponentielle du nombre de cas et de décès associée à la maladie en si peu de temps de temps. 
Les différences de prévalence et de formes graves de la maladie constatés ont révélé des fragilités et inégalités à l’échelle individuelle, sociale et sociétale. Toutefois, cette vulnérabilité face à l’épidémie qu’elle soit d’ordre physique, organique, psychologique et sociale n’arrive pas à expliquer à elle seule les disparités enregistrées dans différentes régions du globe et à l’intérieur même des pays.
Ce thème étant plus large, nous allons traiter uniquement dans ce document les facteurs de risque individuels et biologiques de mortalité de l’infection par le virus SARS-Cov2.

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Webinaire sur la prise en charge non invasive de la détresse respiratoire COVID-19

Le Webinaire sur le traitement instrumental non invasif de la détresse respiratoire de l'infection COVID organisé par l’AFTP et l'ATUFORCAL tenu le 10 juillet 2020 et animé par le Pr Jésus Gonzalez à été très réussi et bien discuté. Nous avions beaucoup appris de l'expérience de son équipe et nous avions fixé les idées sur l'apport des mesures instrumentales non invasives hors réanimation du SDRA lié au COVID.
Le webinaire a été mis en ligne sur Youtube et sur le site de l'AFTP.

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Visioconférence de l'EFP présentée par :

Pr Bruno Crestani
chef de service de Pneumologie de l’hôpital Bichat – Claude-Bernard à Paris.
Coordonnateur du centre de référence constitutif des maladies pulmonaires rares de l’adulte et du DHU FIRE (Fibrose, Inflammation et Remodelage)  sur la prise en charge des patients COVID après la phase aiguë,

Date : Jeudi 9 juillet 2020.

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Interview d'actualité sur la pandémie COVID-19 
Rochelle Walensky, MD, Harvard University

L'interview traite de la situation aux USA, de la sensibilité des tests PCR et tests rapides, de l'impact des gouttelettes et aérosols dans la transmission du SRAS-CoV-2, des traitements disponibles pour la COVID-19, des phénotypes COVID-19, des thérapies pour prévenir l'hospitalisation, de l'interféron alpha et tocilizumab, de la raison de la flambée épidémiologique aux États-Unis?, de la prévention des infections, des modalités de réouverture des écoles, maternelle, collèges et universités, de la grippe, des vaccins contre la grippe en automne, de l'immunité collective et de l'expérience suédoise et du risque de changement génétique et mutation du virus.

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L'Organisation mondiale de la santé a publié un nouveau guide qui résume ce que l'on sait des différentes façons dont le coronavirus peut transmettre : implications pour les précautions de prévention des infections.
Certains rapports ont suggéré la possibilité de transmission d'aérosols, combinée à la transmission de gouttelettes, dans des espaces intérieurs surpeuplés  par exemple, dans les restaurants, cependant la transmission dans ces cas pourrait également être expliquée par un contact étroit ...

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Rôle de la recirculation de l'air dans l'infection par COVID-19, leçons tirées du navire de croisière Diamond Princess
MedRxiv . Orouba Almilaji. Publié le 9 juillet

Le bateau de croisière Diamond Princess est un cas unique car c'est l'endroit où la capacité de test a atteint son taux le plus élevé au monde pendant la pandémie de COVID-19.
En analysant les données collectées sur l'épidémie actuelle de COVID-19 à bord, et en considérant la conception du système de climatisation des navires et les modes de transmission des virus sur les paquebots de croisière.
La transmission aérienne de COVID-19 par le système de ventilation à bord pourrait expliquer la propagation du virus dans les cabines pendant la période de quarantaine.

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Vaccins, plasma de patients convalescents et anticorps monoclonaux pour la Covid-19

Herb F Sewell. BMJ 2020;370:m2722, publié le 9 juillet 2020

La pandémie dévastatrice causée par le coronavirus SARS-CoV-2 semble être un candidat de choix pour les approches traditionnelles de prévention (vaccins) et d'immunité passive. L'immunité passive, utilisant du plasma de patients convalescents récupérés ou des anticorps monoclonaux avec des niveaux élevés d'activité antivirale neutralisante, a un potentiel à la fois thérapeutique et préventif.
Dans le monde entier, de nombreux vaccins Covid-19 sont à différentes phases de développement. Il est compréhensible que le public s'attende à ce que ces efforts soient couronnés de succès, mais prudence est nécessaire en ce qui concerne les vaccins et l'immunité passive.

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Risque accru de COVID-19 chez les utilisateurs d'inhibiteurs de la pompe à protons
American College of Gastroenterology (ACG). Christopher V. et al.  7 Juillet 2020

Les résultats d'une enquête en ligne auprès de plus de 53000 Américains suggèrent que l'utilisation de médicaments contre les brûlures d'estomac appelés inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) une ou deux fois par jour augmente considérablement les chances d'un test positif pour COVID-19 par rapport à ceux qui ne prennent pas d'IPP.
Cette recherche apparaît en ligne aujourd'hui en format pré-imprimé dans l'American Journal of Gastroenterology.
Les auteurs ont mené une grande enquête en ligne pour évaluer si l'utilisation des IPP augmente le risque de COVID-19.
Les coronavirus sont facilement détruits à un pH gastrique inférieur à 3, mais survivent à un pH plus neutre, favorisé par la prise des IPP.
Il est à noter par ailleurs que le nombre de récepteurs ACE-2, présents dans le tube digestif est à  environ 100 fois plus élevé que dans toute autre partie du corps, y compris les poumons.

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Tests diagnostiques de l'infection Covid-19. Foire aux questions
Clinical Infectious Diseases, ciaa742,
Ferric C Fang et al. Publié le 8 Juin 2020

Les tests diagnostiques ont joué et continueront de jouer un rôle majeur dans la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
La capacité de détecter le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans les sécrétions respiratoires est essentielle pour déterminer si un individu est infecté et potentiellement infectieux pour les autres.

La détection virale est utilisée pour l'identification, la gestion et l'isolement de patients individuels, elle est également utilisée pour déterminer quand le virus est entré dans une communauté et à quelle vitesse il se propage.
Alors que les communautés tentent de rouvrir après des périodes d'arrêt, la détection du SRAS-CoV-2 et d'anticorps spécifiques qui reconnaissent le virus deviendra de plus en plus importante comme moyen d'évaluer l'infection et l'immunité chez les individus et les communautés.

Ici, nous discutons des questions fréquemment posées par les cliniciens au sujet des tests de diagnostic COVID-19.

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Six mois sous le coronavirus. Quelles leçons en tirer des des principales stratégies d'atténuation COVID-19 dans le monde  
Think Global Health. Theo Vos et al. 9 juillet 2020

Alors que le monde passe tranquillement le sixième anniversaire de la désignation par l’Organisation mondiale de la santé du nouveau coronavirus comme urgence de santé publique de portée internationale (USPPI), ce n’est guère une nouvelle que COVID-19 a touché certains pays beaucoup plus que d’autres.
Alors que les États-Unis ont dépassé trois millions de cas et 135 000 décès, la Corée du Sud - un autre pays riche et technologiquement avancé avec une grande population urbaine - a enregistré moins de 300 décès dus à COVID-19.
D'autres exemples de pays s'en sortent bien tandis que d'autres peinent, et pas seulement en comparant des nations aussi différentes que les États-Unis et la Corée du Sud.
Malgré leurs nombreuses similitudes, les voisins scandinaves de la Suède et de la Norvège pourtant voisins ont eu des expériences très différentes de COVID-19 : plus de 5.000 décès liés au COVID-19 en Suède alors que la Norvège en a vu moins de 250.
Même constat, entre Cuba et Brésil alors qu'ils sont deux pays tropicaux d'Amérique latine à revenu intermédiaire...

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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5 Juillet 2020

 
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Formes asymptomatiques de la COVID-19
Pr Fatma CHERMITI

L’infection par le SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) est caractérisée par sa forte contagiosité en comparaison avec l’infection par le SARS-CoV et le MERS-CoV, expliquant le taux important de patients infectés, qui a atteint le 5 juillet 2020 11 409 797 personnes de part le monde, dont 4 416 911 cas actifs. La présentation clinique varie des formes complètement asymptomatiques jusqu’aux formes sévères avec détresse respiratoire.
Les formes asymptomatiques constituent également une source importante d’infection et donc de transmission de la maladie, pouvant contribuer à la propagation de la pandémie COVD-19. D’où la nécessité de les identifier, les isoler et les traiter afin de limiter cette propagation et diminuer la mortalité de la maladie ...

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Webinaire sur la prise en charge non invasive de la détresse respiratoire COVID-19
Le vendredi 10 juillet 2020 - 18h - 19h30 heure de Tunis

L'association Franco-Tunisienne de Pneumologie organise un webinaire sur l'infection COVID-19 animé par Pr Jesus Gonzalez Pneumologue praticien hospitalier, expert en prise en charge ventilatoire, Professeur a la faculté de médecine Sorbonne-université Département R3S, réanimation, réhabilitation, respiration et sommeil, hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris.
Modération :
Dr Lassaad Fakhfakh président de l'AFTP
Pr Besma Dhahri.
Conférence : détresse respiratoire aigue de l'infection COVID-19 : Indications et modalités du traitement instrumental en dehors de la ventilation invasive.

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Regards croisés face à l’infection COVID.
Intervenants : Dr Leïla Slim, Tunis – Pr Dan Adler, Genève
Pr Yakoba Toloba, Bamako – Pr Gilles Allali, Genève

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D'après le chef de l'OMS sur la pandémie de COVID-19 : Le pire reste à venir

Le chef de l'Organisation mondiale de la santé a averti que la pandémie de COVID-19 s'accélère.
Il a déclaré que nous voulons tous que cela se termine et nous voulons tous continuer notre vie.
Mais la dure réalité est que ce n'est même pas près d'être terminé.
La pandémie s'accélère à l'échelle mondiale", a-t-il déclaré,  la solution est la même depuis les premiers jours de la pandémie : "Tester, tracer, isoler et mettre en quarantaine".

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Reconnaissant le rôle utile que les études expérimentales de provocation chez des volontaires adultes en bonne santé ont joué dans le développement de certains vaccins, certains ont préconisé un rôle pour de telles études avec SARS-CoV-2 virulent. Ce guide de l'OMS a été établi pour étudier la faisabilité, la valeur potentielle et les limites de surveillance rapprochée d'un modèle expérimental : adulte sain.

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La tempête cytokinique : est elle attribuée au COVID-19
JAMA Intern Med. Published online June 30

La tempête Cytokine n'a pas de définition. D'une manière générale, elle témoigne d'une réponse immunitaire hyperactive caractérisée par la libération d'interférons, d'interleukines, de facteurs de nécrose tumorale, de chimiokines et de plusieurs autres médiateurs.
Ces médiateurs font partie d'une réponse immunitaire innée bien conservée nécessaire à l'élimination efficace des agents infectieux.
La tempête des cytokines implique que les niveaux de cytokines libérées sont nocifs pour les cellules hôtes.
Distinguer une réponse inflammatoire appropriée d'une réponse inflammatoire dérégulée dans la physiopathologie des maladies graves, a été un défi majeur.

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Le vaccin Covid-19 de Pfizer et BioNTech a montré des résultats positifs

MedRxiv Preprint - 1er juillet 2020

Un vaccin expérimental Covid-19 développé par le géant pharmaceutique Pfizer et la société de biotechnologie BioNTech a stimulé les réponses immunitaires chez les patients en bonne santé, mais a également provoqué de la fièvre et d'autres effets secondaires, en particulier à des doses plus élevées.
Le vaccin est basé sur une technologie appelée ARN messager, qui utilise un messager génétique clé présent dans les cellules pour créer des protéines que le système immunitaire apprend ensuite à attaquer.
Actuellement, quatorze vaccins Covid-19 sont actuellement en phase d'essais cliniques chez l'homme .

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Applications de la technologie numérique dans la planification et la réponse à la pandémie de COVID-19   
The lancet Digital Health
Etude publiée: 29 Juin 2020

Avec une transmissibilité élevée et en l'absence de vaccin ou de traitement efficace, COVID-19 est maintenant une pandémie mondiale. Les efforts coordonnés par les gouvernements à travers le monde se sont concentrés sur le confinement et l'atténuation, avec plus ou moins de succès.
Les pays qui ont maintenu de faibles taux de mortalité par habitant COVID-19 semblent partager des stratégies qui incluent une surveillance précoce, des tests, la recherche des contacts et une quarantaine stricte. L'ampleur de la coordination et de la gestion des données nécessaires à la mise en œuvre efficace de ces stratégies a, dans la plupart des pays prospères, reposé sur l'adoption de la technologie numérique et son intégration dans les politiques et les soins de santé.
Ce point de vue fournit un cadre pour l'application des technologies numériques dans la gestion et la riposte aux pandémies, en soulignant les façons dont les pays qui ont réussi ont adopté ces technologies pour la planification, la surveillance, les tests, la recherche des contacts, la quarantaine et les soins de santé en cas de pandémie.

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La climatisation contribue-t-elle à propager COVID dans le Sud?
The Harvard Gazette, publié le 29 Juin 2020
Edward Nardell.

Les États qui, en juin, utilisent déjà beaucoup de climatisation en raison des températures élevées sont également les endroits où l'augmentation de la propagation du COVID-19 a augmenté.
Bien que la transmission du virus du SRAS-CoV-2 soit réputée se transmettre principalement par le biais de grosses gouttelettes expulsées lors de la toux, des éternuements ou des conversations, il est pouvé aussi qu'au moins certains cas de COVID-19 se transmettent par voie aérienne.
Cela se produit lorsque les particules virales contenues dans de plus petites gouttelettes ne se déposent pas à moins de six pieds et au lieu de cela pendent dans l'air et dérivent sur les courants.
On pense que la transmission par voie aérienne a été un facteur de propagation du coronavirus parmi les membres d'une chorale de Washington, à travers un immeuble à Hong Kong et dans un restaurant à Wuhan, en Chine.
La transmission par voie aérienne rendrait les gens encore plus vulnérables au virus dans une pièce fermée.
dans un espace fermé sous la climatisation, la fraction d'air recyclé augmente, et le risque d'infection devient dramatique

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Mortalité et la morbidité
La mesure d'une pandémie
JAMA. Publié en ligne le 1er Juillet 2020

La mortalité semble être une mesure précise de l’évolution et des effets de la pandémie - le pire résultat, un résultat sans équivoque.
Cependant, le nombre de décès attribués au COVID-19 dans les rapports officiels sous-estime probablement le nombre des décès causés par le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2).
En outre, la statistique n'inclut pas les décès indirectement imputables au virus et les mesures utilisées pour le contenir.
Au début de la pandémie, les personnes décédées de COVID-19 peuvent ne pas avoir été reconnues en raison d'une connaissance insuffisante de l'infection ou du manque de disponibilité des tests, et leur décès peut avoir été attribué à une autre maladie respiratoire, telle que la grippe.
A la maison ou dans les maisons de retraite les décès ne seraient pas comptés dans la mortalité liée à la pandémie.
De plus, d'autres décès non attribuables au COVID-19 peuvent avoir été causés par la pandémie, notamment en raison de préoccupations concernant l'exposition au SRAS-CoV-2 et des mesures de distanciation sociale.

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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28 Juin 2020

 
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Apport des antiviraux dans la COVID-19
Pr Samira AOUADI

La Coronavirus disease 2019 ou COVID-19 est une maladie très contagieuse liée au nouveau coronavirus 2 découvert en décembre 2019. La majorité des patients atteints de COVID-19, présentent des symptômes légers à modérés. Toutefois, près de 5-10% présent une forme grave potentiellement mortelle liée essentiellement à la pneumopathie. Plusieurs traitements ont été essayés dans la prise en charge de la COVID-19, mais aucun traitement n’a montré une efficacité. 
Depuis la découverte de la COVID-19 en décembre 2019, de nombreux antiviraux ont été testés in vitro et aussi in vivo.

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Questions et réponses sur le coronavirus : la prochaine phase COVID-19
Diffusé en direct le 24 juin 2020

Séances de questions réponses animée par Dr Bauchner du JAMA et Pr Michael Osterholm, épidémiologue membre de l'Institut de médecine de la National Academy of Sciences, il est aussi directeur du Center for Infectious Disease Research and Policy (CIDRAP) de l’université du Minnesota. Thème principal : Augmentation estivale des cas de COVID-19 aux États-Unis, des perspectives de réouverture des écoles et d'une «deuxième vague» à l'automne, et plus encore.

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Webinaire de l'AFMAPATH animé par le Pr Jesus Gonzalez.

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Recommandations de gestion des soins intensifs des adultes atteints de COVID-19 pendant la pandémie de coronavirus  

Cette orientation clinique fournit des informations actuelles sur la prise en charge des patients adultes gravement malades atteints de COVID-19 aux cliniciens praticiens au chevet du patient.

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Scientific American présente sur ce site des explications détaillées, à ce jour, sur la façon dont le SRAS-CoV-2 infecte les cellules humaines et comment le système immunitaire réagit et comment les médicaments et les vaccins pourraient combattre le virus, ces données sont actualisés au fur et à mesure que la science avance.

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Recommendations pour l'utilisation de la Dexamethasone chez les patients COVID-19
The National Institutes of Health COVID-19 Treatment Guidelines Panel

Suite aux résultats d'un grand essai multicentrique, randomisé, mené auprès de patients hospitalisés au Royaume-Uni ayant montré que les patients randomisés pour recevoir de la dexaméthasone avaient un taux de mortalité réduit par rapport à ceux qui recevaient des soins standard.
Le comité des recommandations thérapeutiques COVID-19 recommande l'utilisation de la dexaméthasone (à une dose de 6 mg par jour pendant 10 jours maximum) chez les patients atteints de COVID-19 ventilés mécaniquement  et chez les patients atteints de COVID-19 qui nécessitent de l'oxygène non ventilés.

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PulmCrit – Dexamethasone & COVID – a study in immunopathology, evidence-based medicine, and ourselves

Par Josh Farkas

Cet article dresse une analyse critique de la littérature autour de l'efficacité des corticoides dans l'infection COVID.

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Une nouvelle revue Cochrane évalue la précision des tests d'anticorps pour détecter le COVID-19  
Cochrane Systematic Review - Diagnostic Etude publiée: 25 Juin 2020

L'étude montre que les tests d'anticorps pourraient avoir un rôle utile pour détecter si quelqu'un a eu COVID-19, qui est d'ailleur une information importante.
Les tests étaient plus efficaces pour détecter COVID-19 chez les personnes deux semaines ou plus après le début de leurs symptômes, mais nous ne savons pas dans quelle mesure ils fonctionnent plus de cinq semaines après le début des symptômes.
Nous ne savons pas si cela est vrai pour les personnes qui ont une forme bénigne ou asymptomatique, car la majorité des études de la revue systématique ont été principalement effectuées chez des personnes hospitalisées.
Avec le temps, nous saurons si le fait d'avoir déjà eu COVID-19 confère aux individus une immunité contre une infection future.

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Complications neurologiques et neuropsychiatriques du COVID-19
The lancet Psychiatry, publié le 25 Juin 2020
Aravinthan Varatharaj et al.

Les inquiétudes concernant les complications neurologiques potentielles de COVID-19 sont de plus en plus signalées, principalement en petites séries.
Les études plus importantes ont été limitées à la fois par la géographie et la spécialité.
Une caractérisation complète des syndromes cliniques est cruciale pour permettre une sélection et une évaluation rationnelles des thérapies potentielles.
Le but de cette étude était d'étudier l'ampleur des complications de COVID-19 à travers le Royaume-Uni qui ont affecté le cerveau.
L'altération de l'état mental était la deuxième présentation la plus courante, avec l'encéphalopathie ou l'encéphalite et d'autres manifestations  psychiatriques, survenant souvent chez des patients plus jeunes.

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Coronavirus : les personnes asymptomatiques peuvent développer des dommages pulmonaires
The Conversation. Publié le 25 June 2020

Des données sur le sujet sont publiées, la première étude de  Wuhan, en Chine, décrivait des opacités en verre dépoli et consolidation sur le scanner thoracique de patients complètement asymptomatiques, compatibles avec une inflammation du tissu pulmonaire sous-jacent non spécifiques à l'infection par le SRAS-CoV-2.
Ce qui représente par ailleurs un cauchemar pour la santé publique, on estime que 40 à 45% des personnes infectées par le SRAS-CoV-2 restent asymptomatiques, avec une charge virale aussi élevée que celles qui sont activement malades. Ajoutez à cela le taux significatif de faux négatifs allant jusqu'à 20% pour les tests de dépistage (patients informés à tort qu'ils n'ont pas l'infection), ces patients continuent à éliminer le virus jusqu'à 14 jours ce qui soulève des questions sur l'efficacité de la stratégie de tests ou l'utilisation de mesures de dépistage telles que la vérification de la température.
La présence de lésions sur un scanner n'indique pas si un traitement est nécessaire, cela nécessite toujours une décision personnalisée basée sur le jugement clinique

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COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
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21 Juin 2020

 

Tests sérologiques rapides : principes, indications et limites
Pr Meriem MJID

La RT-PCR (reverse-transcription polymerase chain reaction) reste la technique de référence pour le diagnostic biologique du SARS-CoV-2. Toutefois, plusieurs enjeux d’ordre médical, sociétal, organisationnel et de santé publique ont amené au développement de techniques de diagnostic rapide.
En effet, l’OMS recommande actuellement un dépistage de masse de la COVID-19. Toutefois, pour des raisons techniques et logistiques, la capacité de dépistage par la RT-PCR reste limitée.
L'accès à d’autres tests pourrait ainsi faciliter le dépistage de masse, identifier les foyers potentiels de la maladie et suivre le traitement. Les tests de diagnostic rapide (TDR) apparaissent comme une alternative très intéressante dans ces indications. ...

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Webinaire STMRA/SPLF/EFP/SAPLF/SSP
jeudi 25 juin de 18h à 20h

La Société Tunisienne des Maladies Respiratoires et d’Allergologie STMRA organise conjointement avec Société de Pneumologie de Langue Française SPLF, l'Espace Francophone de Pneumologie EFP, La Société Africaine de Pneumologie de Langue Française SAPLF et la Société Suisse de Pneumologie SSP un webinaire intitulé : Regards croisés face à l'infection COVID

Programme :

  1. Tests diagnostiques : que nous disent ils ? comment les utilisons nous ? Pr Leila Slim (Tunis).
  2. Pneumopathie Covid quels supports respiratoires en dehors des soins intensifs ?
  3. Pr Dan Adler (Genève). Données épidémiologiques africaines : impact des antipaludéens ?
  4. Pr Yacouba Toloba (Bamako). Encéphalopathie liée au virus SARS-Cov2 SACRE. Pr Gilles Allali (Genève).

Animation : Dr Frank Soyez (Paris) – Pr Agnès Hamzaoui (Tunis)
Le webinaire se termine par une séance de questions-réponses.

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La coagulopathie dans l'infection COVID 
J Thromb Haemost, Publié le 18 Juin 2020
Toshiaki Iba et al.

D'après des rapports récents, les patients les plus gravement graves présentant une coagulopathie et une formation massive de caillots intravasculaires de type coagulation intravasculaire disséminée (CIVD) sont fréquemment observés dans cette cohorte. Par conséquent, les tests de coagulation peuvent être considérés comme utiles pour distinguer les cas graves de COVID-19.
La présentation clinique de la coagulopathie associée à COVID-19 est principalement un dysfonctionnement organique, tandis que les événements hémorragiques sont moins fréquents.
Les changements dans les biomarqueurs hémostatiques représentés par l'augmentation des D-dimères et des produits de dégradation de la fibrine / fibrinogène.
En comparaison avec la CIVD associée à une septicémie bactérienne, la prolongation du temps de prothrombine et le temps de thromboplastine partielle activée et la diminution de l'activité antithrombine sont moins fréquentes et la thrombocytopénie est relativement rare dans COVID-19.
Les mécanismes de la coagulopathie ne sont cependant pas entièrement élucidés. On suppose que les réponses immunitaires dérégulées orchestrées par des cytokines inflammatoires, la mort cellulaire des lymphocytes, l'hypoxie et les dommages endothéliaux sont impliquées ...

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Sévérité du COVID-19 et diabète sucré: il y a encore beaucoup à apprendre.

Arch Endocrinol Metab - Publié le 11 juin
Rodacki, Melanie.

Le diabète a également été associé à une augmentation de la gravité des infections bactériennes et virales, y compris la grippe H1N1. Cependant, COVID-19 a été associé principalement au diabète type 2 et, à ce jour, pas d'augmentation de la fréquence des cas graves de COVID-19 chez les enfants, les adolescents et les jeunes patients atteints de diabète de type 1.

Le rôle potentiel de l'obésité et du syndrome métabolique dans l'association entre le diabète et la gravité de COVID-19 pourrait soulever la question de savoir si l'hyperglycémie elle-même aurait une influence sur les résultats des patients atteints de COVID-19. Les preuves indiquent que l'hyperglycémie aggrave le pronostic et augmente le risque de décès, en particulier l'hyperglycémie à l'admission à l'hôpital.
L'hyperglycémie aiguë augmente la production de médiateurs inflammatoires qui pourraient potentialiser la «tempête de cytokines» observée dans les cas graves de COVID-19. Bien que de nouvelles informations soient ajoutées quotidiennement aux connaissances actuelles sur l'association entre le diabète et le COVID-19, il reste encore un long chemin à parcourir afin de réduire la fréquence des graves COVID-19 et des décès chez les sujets diabétiques (en particulier dans le Type 2), jusqu'à ce que le vaccin et les options de traitement soient disponibles pour une utilisation clinique.

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Innovation dans la prestation des soins contre le cancer à l'ère de COVID-19 
Journal of Oncology .  publié en ligne le 17 juin 2020
Auteurs : Samyukta Mullangi et al.

Du jour au lendemain, la pandémie de COVID-19 a bouleversé les façons habituelles dont les soins de santé sont pratiqués et dispensés.
Alors qu'autrefois notre écosystème de soins de santé reposait sur une doctrine de capacité et de débit élevés, le risque de contagion et de propagation est désormais si élevé que les prestataires et les patients cherchent tous les deux à minimiser autant que possible les points de contact avec le système de santé.
Le COVID-19 a affecté négativement les soins contre le cancer à bien des égards, mettant les patients et les professionnels de la santé à risque au cours d'un parcours de traitement déjà stressant.
De nombreux fournisseurs de soins anticancéreux ont été tenus de limiter les visites de nouveaux patients, de suspendre tous les essais cliniques et de retarder les soins cliniques non urgents. Cependant, la doublure argentée de la crise est que les incitations établies de force par COVID-19 peuvent conduire à des soins de plus grande valeur et plus centrés sur le patient.
nous espérons qu'au moins les changements axés sur le patient que nous assistons dans le secteur de la prestation peuvent durer.

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Combinaison des tests sérologiques à anticorps totaux et du test RT-PCR pour la détection des infections au SRAS-CoV-2.
J Virol Methods, publié le 15 Juin 2020
Auteur : PeiWang

Le but de cette étude était d'étudier la faisabilité des tests sérologiques à anticorps totaux combinés à la RT-PCR pour la détection du SRAS-COV-2.
Il s'agit d'une étude rétrospective dans laquelle 375 patients ont été recrutés lors de l'épidémie de SRAS-COV-2.
Les résultats ont indiqué que la sensibilité et la spécificité diagnostiques étaient de 95,7% et 98,7%, 92,2% et 100% selon les tests d'anticorps totaux et la RT-PCR, respectivement. La sensibilité et la spécificité des tests d'anticorps totaux combinés à la RT-PCR étaient de 98,6% et 98,7%.
La sensibilité de la méthode combinée était significativement plus élevée que la RT-PCR (X2 = 5,16, P <0,05) et similaire à celle des tests d'anticorps total (X2 = 1,15, P> 0,05).
Cette étude a soutenu l'avantage de la méthode combinée de détection du SRAS-COV-2 avec un degré élevé de sensibilité et de spécificité, en tant qu'outil utile pour un diagnostic précis et un traitement rapide des patients suspects, une enquête épidémiologique, ainsi que la surveillance des épidémies de infections par le SRAS-COV-2.

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Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure   
NEJM. Publié le 17 Juin 2020 - Ellinghaus D et al

Objectifs : Identifier les facteurs génétiques potentiellement impliqués dans le développement et l'évolution du COVID-19 Méthodes  :

  • Etude d'association pangénomique
  • Inclusion de 1980 patients atteints du COVID-19 dans une forme sévère (définie comme une insuffisance respiratoire) dans sept hôpitaux des épicentres italien et espagnol de la pandémie de SARS-CoV-2 en Europe
  • Analyse qualité et exclusion des valeurs aberrantes de la population conduisant à l'inclusion de 835 patients et 1255 participants témoins en Italie ainsi que 775 patients participants et 950 témoins en Espagne
  • Au total, 8 582 968 de polymorphismes mononucléotidiques ont été analysés par une méta-analyse à effet fixe. Pour tenir compte de l'incertitude de l'imputation (test des associations phénotypiques avec les données de dosage des allèles séparément pour les panels cas-témoins italien et espagnol via une régression logistique PLINK avec ajustement et stratification notamment sur le sexe et l'âge). Le seuil de signification statistique a été fixée a 5x10^-8.

Cette étude a permis l'identification d'un groupe de gènes 3p21.31 comme locus de susceptibilité génétique chez les patients atteints de COVID-19 avec insuffisance respiratoire. Elle a également confirmé une implication potentielle du système des groupes sanguins ABO.

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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14 Juin 2020

 

Le COVID-19 chez le diabétique ?
Pr Inès Zendah

Le 11 Mars 2020, l’OMS a déclaré la pandémie au coronavirus disease-2019 (COVID-19), pathologie causée par l’infection au coronavirus-2 (SARS-CoV-2).
Par ailleurs, le diabète est l’une des causes principales de morbidité et de mortalité dans le monde. De plus, il est bien connu que les diabétiques présentent un risque accru d’infection notamment par la grippe et la pneumopathie infectieuse avec un plus mauvais pronostic.
Le diabète est en plus une comorbidité fréquente au cours du COVID-19, pathologie qui évolue dans certains cas vers une pneumopathie et même une défaillance multi-viscérale. Tout ceci rend pertinent d’examiner le COVID-19 chez le diabétique.
De manière inattendue, il semble que les diabétiques ne soient pas plus susceptibles à être atteints par le COVID-19 ou le soient juste légèrement ...

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Comment et quand mettre fin au verrouillage COVID-19 : une approche d'optimisation 
Front. Public Health, 10 Juin 2020

Les pays du monde entier sont dans un état de verrouillage pour aider à limiter la propagation du SRAS-CoV-2. Cependant, alors que le nombre de nouveaux cas confirmés par jour commence à diminuer, les gouvernements doivent décider comment libérer leurs populations de la quarantaine le plus efficacement possible sans surcharger leurs services de santé.
Pour limiter la propagation récurrente, les auteurs constatent que mettre fin à la quarantaine simultanément pour l'ensemble de la population est une stratégie à haut risque et qu'une approche de réintégration progressive serait plus fiable.
La stratégie optimale se révèle généralement être de libérer environ la moitié de la population 2 à 4 semaines après la fin d'un pic d'infection initial, puis d'attendre encore 3 à 4 mois pour permettre un deuxième pic avant de libérer tout le monde.
Les auteurs concluent que le pire des scénarios d'une libération progressive est plus gérable que le pire des scénarios d'une stratégie on-off, et mettons en garde contre les stratégies de verrouillage-libération basées sur un mécanisme on-off dépendant du seuil.

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COVID-19 en Afrique: la propagation et la riposte

Nature Medicine - Publié le 11 juin 2020
Marguerite Massinga Loembé et al. COVID-19 continue de se propager en Afrique depuis la première détection du virus sur le continent à la mi-février 2020. Plus de 200 000 cas ont été confirmés à ce jour, avec plus de 5600 décès.
La pandémie s'accélère - il a fallu 98 jours pour atteindre 100 000 cas et seulement 19 jours pour passer à 200 000 cas.
Dix pays sur 54 sont actuellement à l'origine de l'augmentation du nombre, représentant près de 80% de tous les cas.
Plus de 70% des décès surviennent dans seulement cinq pays: l'Algérie, l'Égypte, le Nigéria, l'Afrique du Sud et le Soudan. L'Afrique du Sud est la plus touchée, représentant 25% du total des cas sur le continent, les provinces du Cap occidental et du Cap oriental signalant quotidiennement un nombre élevé de cas et de décès.
Plus de la moitié des pays du continent connaissent une transmission communautaire COVID-19. Dans de nombreux cas, cela se concentre dans les capitales, mais les cas se propagent dans les provinces.

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Revue de la littérature

SARS-CoV-2 COVID-19 susceptibility and lung inflammatory storm by smoking and vaping
Journal of Inflammation volume 17, Article number: 21

Des preuves suggèrent que le domaine S1 du pic de membrane du SRAS-CoV-2 (agent causal de COVID-19) a une affinité élevée envers le récepteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) trouvé sur l'épithélium pulmonaire de l'hôte. De même, la protéase TMPRSS2 s'est avérée cruciale pour l'activation virale, facilitant ainsi l'entrée du virus dans la cellule, il a été démontré que cela provoque une «tempête de cytokines» impliquant une production excessive de cytokines / chimiokines pro-inflammatoires, y compris IL-6, TNF-α, IFN-γ, IL-2, IL-7, IP-10, MCP-3 ou GM-CSF, qui est augmentée par le tabagisme.
Cette mini-revue fournit un compte rendu consolidé sur le rôle de l’inflammation et des réponses immunitaires, des protéases et de la perméabilité épithéliale en fumant et en vapotant pendant l’infection au SRAS-CoV2 avec les orientations futures de la recherche, et fournit une liste des cibles potentielles pour les thérapies contrôlant particulièrement les tempêtes de cytokine dans le poumon.

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Réadaptation après COVID-19 : une approche factuelle
Clinical Medicine, publiée le 9 Juin 2020
Auteur : Derick T WadeA

COVID-19 a mis au défi tous les soins de santé, y compris la réadaptation, et continuera de le faire pendant au moins quelques années.
Après une forme sévère de l'infection COVID-19, de nombreux patients connaîtront divers problèmes de fonctionnement normal et auront besoin de services de réadaptation pour surmonter ces problèmes.
Les principes et les preuves de la réadaptation permettront une réponse efficace. Il s'agit notamment d'un processus de sélection simple; recours à une équipe d'experts multidisciplinaire.
Les interventions sont fondées sur des données probantes : exercice, pratique, soutien psychosocial et éducation, en particulier sur l'autogestion ; et une gamme d'interventions sur mesure pour d'autres problèmes.

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Estimating the effects of non-pharmaceutical interventions on COVID-19 in Europe  
Nature. Publié le 8 Juin 2020 - Flaxman S et al

Cette étude estime que, pour tous les pays qu’elle considère, les interventions actuelles ont été suffisantes pour ramener le numéro de reproduction Rt en dessous de 1 (la probabilité Rt < 1,0 est de 99,9 %) et parvenir à contrôler l'épidémie.
Cette étude estime qu'il y a eu beaucoup plus d'infections que celles qui sont actuellement signalées, c'est-à-dire que, dans l'ensemble des 11 pays, entre 12 et 15 millions d'individus ont été infectés par le SARS-CoV-2 jusqu'au 4 mai, ce qui représente entre 3,2 % et 4,0 % de la population. Malgré cela, cette étude estime que seule une minorité relativement faible d'individus dans chaque pays a été infectée.
Ces estimations impliquent que les populations en Europe ne sont pas proches de l'immunité collective (~70% si R0 est de 3,8).

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




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Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
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7 Juin 2020

 
 

L’infection à coronavirus (SARS-Cov2) chez les enfants : quelles particularités ?
Pr Besma Hamdi

A cette date, toutes les données disponibles suggèrent que l'infection par le nouveau coronavirus chez les enfants semble être moins sévère. Environ 1 à 5 % des cas rapportés du COVID-19 en sont rapporté chez l’enfant dans le monde.
Selon les données épidémiologiques chinoises, il a été rapporté que parmi 44672 cas confirmés, il y avait 416 enfants atteints de cette maladie âgés de 0 à 9 ans soit 0,9% des cas et 549 cas confirmés étaient âgés de 10 à 19 ans soit 1,2% des cas. Un seul décès était déploré dans le groupe d’enfants âgés plus de 10 ans (0,2%). En Tunisie, parmi les 1087 cas confirmés jusqu’à ce jour nous avons détecté 79 enfants âgés de moins de 18 ans ...

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Webinaire OMS sur l'infection Covid-19
Le mercredi 10 juin 2020 à partir de 14h

Le bureau Tunisien de l’Organisation mondiale de la Santé vous invite à son deuxième webinaire autour de la thématique COVID-19.
La discussion portera sur le partage d’expérience dans la prise en charge des patients COVID+ dans le Service de réanimation de l’Hôpital Abderrahmane Mami et sera dirigée par Dr Jalila BEN KHELIL. Date : Mercredi le 10 Juin 2020
Heure : de 14 : 00 h à 15 : 30 h (heure locale de Tunis)

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L’industrie du tabac en Tunisie et COVID-19
Pr Radhouane Kammoun

Dans son article du 31 mars 2020, Réalités on line a rapporté que la Régie Nationale des Tabacs et des Allumettes (RNTA) a fait don d’une somme de 100,000 DT au compte 1818 consacré au Fond National de la lutte contre la SARS-COV2 virus responsable du COVID19.
Ce virus a infecté selon un bilan officiel actualisé, près de 1032 personnes et a coûté la vie de 45 personnes. Ainsi, selon cet article, le RNTA a participé par ce don à l’effort national de lutte contre l’épidémie COVID-19.
Toutefois je voudrais préciser qu’a côté de cette épidémie récente, une épidémie sévit en Tunisie depuis des décennies qu’est l’épidémie du tabagisme. Cette épidémie dont l’industrie de tabac constitue le vecteur principal est responsable de 30 à 40 décès par jour à Tunisie.
Il y a lieu de préciser aussi que la Tunisie est placée parmi les 10 premiers pays ayant la fréquence du tabagisme masculin le plus élevé dans le monde. ...

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Normes des explorations fonctionnelles respiratoires (EFR) et questionnaires de qualité de vie (QDV) validés pour la population Tunisienne

À un stade avancé, L'asthme et la BPCO peuvent engager le pronostic vital, pour cela une prise en charge adéquate de ces maladies incluant une lutte contre le tabagisme, un dépistage précoce des maladies, un diagnostic précis, et un suivi adéquat est primordiale.
Dans ce cadre, les explorations fonctionnelles respiratoires (EFR) et les questionnaires de qualité de vie (QDV) ont un grand apport dans la gestion de ces maladies, cette étude se propose de rassembler toutes les normes des EFR disponibles pour la population Tunisienne, ainsi que les questionnaires de QDV spécifiques aux malades respiratoires chroniques et qui ont été validés en Tunisie. La Tunisie Médicale - 2020 ; Vol 98 ( n°05 ) : 378-395
Rim Kammoun, Helmi Ben Saad

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Revue de la littérature

Trois des quatre auteurs de l’étude du «Lancet» rétractent leur article sur l'hydroxychloroquine

À peine deux semaines après sa publication, l'étude observationnelle publiée dans le journal médical The Lancet le 22 mai 2020 a été finalement retirée par la revue, après la demande de rétractation de trois des auteurs de l'étude, qui avouent ne pas pouvoir garantir la véracité des données analysées.
Cette étude revendiquait avoir analysé 96 032 dossiers de patients Covid +, en provenance de 671 hôpitaux des six continents. Elle trouvait une surmortalité de 30% chez les patients traités à l'hydroxychloroquine, ce qui avait amené l'OMS et plusieurs pays à suspendre leurs essais utilisant cette molécule.
Surgisphère, la société ayant récolté les données, a refusé de mettre à disposition des données nécessaires pour l'audit à cause des accords de confidentialité passés entre cette entreprise et ses clients. Ce qui a amené les auteurs à demander la rétractation de leur étude.

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COVID-19: 10 things I wished I’d known some months ago
Intensive Care Medicine. Published: 03 June 2020

La pandémie de COVID-19 sévit encore, elle affecte plus de 200 pays. Bien que des articles liés au COVID-19 soient publiés chaque jour, y compris des recommandations pour une prise en charge clinique optimale, il y a plusieurs problèmes pratiques que nous aurions souhaité avoir connus plus tôt.
Cette mise au point vue aborde 10 points relatifs à la logistique et la prise en charge en milieu de soins des patients COVID-19 gravement malades.
 Les points discutés dans l'article sont : la prise en charge des patients en USI et la gestion du dépassement de sa capacité, la gestion du personnel soignant, l'apport des biomarqueurs, les complications thrombo-emboliques, l'atteinte cardiaque, le traitement pharmacologique, la ventilation mécanique, le foisonnement des courriers et idées de recherche, la prise en charge en post réanimation et le suivi ultérieur des patients.

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COVID-19 vaccine development pipeline gears up. 
The lancet. Published online 06 June 2020

Depuis que les autorités chinoises ont partagé la séquence génétique du SARS-CoV-2, la course au vaccin contre le coronavirus est lancée.
Les chercheurs sont confrontés à plusieurs difficultés majeures. Jamais auparavant la course contre la montre dans la recherche vaccinale n’aura été aussi serrée.
La Food and Drug Administration des États-Unis n'a approuvé un premier vaccin contre le virus Ebola que l'année dernière, 43 ans après la découverte du virus mortel. La recherche a peu progressé avec le VIH ou le virus respiratoire syncytial, malgré d'énormes investissements.
En moyenne, il faut 10 ans pour développer un vaccin. Avec la crise du COVID-19 qui se profile, tout le monde espère que cette fois-ci la situation sera différente.
L'article dresse l'état des lieux de l'avancement des différents vaccins actuellement en cours d'étude et leur état d'avancement.

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
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31 Mai 2020

 

Infection à coronavirus (SARS-Cov-2) et Tabac
Pr Hafaoua Daghfous

Depuis le début de la pandémie, plusieurs études se sont intéressées à la relation tabac et COVID-19 à travers une évaluation du statut fumeur des patients infectés par le SARS-Cov-2.
Le tabac principal facteur de risque de nombreuses infections respiratoires et de maladies non transmissibles telles que le cancer broncho-pulmonaire, les maladies cardio-vasculaires, le diabète, les broncho-pneumopathies chroniques obstructives (BPCO), altère et fragilise le système immunitaire et ce sont les personnes souffrant de ces maladies qui sont les plus susceptibles de développer des formes graves d’infection COVID-19 avec éventuellement une mortalité plus élevée

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Webinaire sur l'infection Covid-19
Le samedi 6 juin 2020 à partir de 16h

-  Quelles particularités de l'infection Covid-19 chez l'enfant ?
-  L'infection Covid-19 : quels traitements disponibles et quelles pistes thérapeutiques futures ?
Animation : Pr Fatma Tritar ( Ariana) – Pr Nadia Mehiri (Marsa)
Intervenants : Pr Nadia Nathan (Paris) – Pr Loïc Kassegne (Strasbourg).
 
Le lien d'inscription vous sera communiqué bientôt.

Dans notre sélection de webinaires autour du thème de l'infection Covid, nous vous invitons à visionner ce webinaire Éthique de la recherche et COVID-19 tenu le 28 mai 2020, les deux autres sont accessibles via ces liens.

Covid et Afrique » Covid & MTEV »

 

Hydroxychloroquine : Méthodologie, données... Ce qui est reproché à l'étude parue dans The Lancet

Portant sur l'efficacité de l'hydroxychloroquine, l'étude parue sur le Lancet concluait sur l'inefficacité de ce médicament en traitement du Covid-19.
Plus préoccupant encore, l'article pointait du doigt des risques cardiaques importants. Des conclusions qui ont entraîné la suspension de l'évaluation de la molécule dans l'essai Solidarity, mené par l'OMS.
Plusieurs dizaines de scientifiques (cliniciens, statisticiens, chercheurs), issus du monde entier ont adressé une lettre ouverte aux auteurs de l'étude et à l'éditeur de la revue The Lancet, réclamant plus de transparence sur les données de l'étude, remettant en cause la qualité des données et demandant un accès aux données par un comité indépendant.

Lettre ouverte » L'article du Lancet »

L'immunologie de COVID-19 : la modulation immunitaire est-elle une option de traitement?
Lancet Rheumatol 2020 - Online May 20, 2020

La réutilisation des médicaments approuvés est largement adoptée pour lutter contre les maladies émergentes telles que COVID-19, car ces médicaments ont des profils pharmacocinétiques et d'innocuité connus. Compte tenu de l'implication de l'hyperactivation immunitaire et du syndrome de détresse respiratoire aiguë dans les cas mortels de COVID-19, plusieurs médicaments antirhumatismaux modificateurs de la maladie (DMARDS), tels que l'hydroxychloroquine et le tocilizumab, ont été proposés comme thérapies potentielles pour le traitement. de COVID-19. Dans cet article, les aspects immunologiques de COVID-19 et l'implication potentielle des (DMARDS) dans le traitement de cette maladie, sont discutés.

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Revue de la littérature

Les cas asymptomatiques de Covid-19 seraient plus fréquents
BMJ Thorax,
First published May 27, 2020

La prévalence d'une infection «silencieuse» asymptomatique serait beaucoup plus élevée qu'on ne le pense, révèle cette étude retraçant l'isolement forcé des passagers d'un navire de croisière pendant la pandémie actuelle.
L'étude a examiné 217 personnes en croisière à destination de l'Antarctique.
La première fièvre à bord a été signalée huit jours après le voyage.
Au cours des deux semaines suivantes, huit personnes ont dû être évacuées du navire car elles sont tombées malades, seulement 19% des patients présentaient des symptômes. 81% des personnes à bord testés positifs ne présentaient aucun symptôme.
Cette étude renforce la recommandation d'encourager tout le monde à porter des masques en public pour aider à prévenir la propagation du virus.

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Considérations éthiques pour les applications de traçage COVID-19
Nature. 
Published 28 May 27, 2020

Les technologies permettant d'alerter rapidement les personnes lorsqu'elles ont été en contact avec une personne porteuse du coronavirus SARS-CoV-2 font partie d'une stratégie visant à maîtriser la pandémie. Actuellement, au moins 47 applications de suivi des contacts sont disponibles dans le monde (voir go.nature.com/2zc1qhk). Ils sont déjà utilisés en Australie, en Corée du Sud et à Singapour, par exemple et réçement chez nous en Tunisie.
Ces applications fonctionnant sur un téléphone mobile, ils informent les gens qu'ils ont passé du temps près d'une personne atteinte du virus. Les contacts doivent alors répondre selon les règles locales, par exemple en s'isolant.
Les alertes rapides sont essentielles car le temps d'incubation du virus peut aller jusqu'à deux semaines.
Déployer une application de traçage sans considération éthique n'est pas acceptable, elle doit tenir compte des droits et libertés fondamentaux.

Lire l'article » Tracing Apps »

Le monde est encore loin de l'immunité collective contre le coronavirus. New York Times.  Published 28 May 27, 2020 

Le coronavirus a encore un long chemin à parcourir. C’est le message d’une série de nouvelles études à travers le monde qui tentent de quantifier le nombre de personnes infectées. Le nombre officiel de cas sous-estime souvent considérablement le nombre d'infections à coronavirus. Mais dans de nouvelles études qui testent la population plus largement, le pourcentage de personnes qui ont été infectées jusqu'à présent est toujours inférieur à 10%. Les chiffres représentent une fraction du seuil connu sous le nom d'immunité collective, auquel le virus ne peut plus se propager largement.
Le seuil précis d'immunité collective pour le nouveau coronavirus n'est pas encore clair; mais plusieurs experts ont déclaré qu'ils pensaient que ce serait supérieur à 60%.

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
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The New England Journal of Médicine.
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Springer Nature.
Taylor & Francis.
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WHO : The World Health Organization.
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26 Mai 2020

 
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COVID-19 en Afrique : état des lieux
Pr Fatma Chermiti

Alors que la propagation de cette maladie, a pris une vitesse vertigineuse, en Europe et Amérique, en Afrique, elle semble être plus lente. En effet, à la date du 24 mai 2020 et selon le centre africain de contrôle et de prévention des maladies (CDC Afrique), le continent africain compte 110 273 cas confirmés, 3 284 décès, 44 381 guérison et 62 608 cas actifs.
Plus de 65% des cas sont enregistrés en Afrique du Sud, Egypte, Algérie, Nigeria et Maroc.
Certains pensent que le continent africain a été relativement épargné, néanmoins, il n’est pas à l’abri d’une poursuite de la propagation de cette pandémie surtout après l’assouplissement des mesures de prévention dans certains pays et le déconfinement progressif des populations. ...

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Webinaire de la SPLF
Le jeudi 28 mai 2020 à partir de 17h

-  Quels sont les différents profils en réanimation ?
-  Quelles sont les séquelles prévisibles ?
- Les traitements des formes sévères : que sait-on ? Animation : Pr Antoine Magnan (Nantes) – Dr Philippe Fraisse (Strasbourg)
Intervenants : Pr Jesus Gonzalez (Paris) – Pr Bruno Crestani (Paris) – Pr Claire Andrejak (Amiens)

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Webinaire de la STMRA
Samedi 4 juin 2020 

Le prochain webinaire de la STMRA est programmé le samedi 4 juin, autour de l'infection COVID-19.
Deux conférences ont été programmées :
  • L’infection COVID en milieu pédiatrique. Pr Nadia Nathan. Paris.
  • Traitement de l’infection COVID : état des lieux et pistes thérapeutiques futures. Pr Loïc Kassegne. Strasbourg.
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Covid-19 : l'exemple tunisien

Y'a-t-il un miracle tunisien ? Mi-mai, c'est avec soulagement, une pointe de fierté et une prudence de mise que les autorités sanitaires annonçaient que, pour la sixième journée consécutive, aucun nouveau cas n'avait été détecté et aucun décès supplémentaire enregistré.
Au 22 mai, ce pays de douze millions d'habitants ne comptait que 1 046 cas pour 47 décès. Le déconfinement ciblé, en trois phases, a commencé le 4 mai. Depuis, seuls 33 cas supplémentaires et 4 décès ont été enregistrés.

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Revue de la littérature

Hydroxychloroquine or chloroquine with or without a macrolide for treatment of COVID-19: a multinational registry analysis
Lancet,
May 22, 2020

Cette étude multinationale, observationnelle, rétrospective sur données de registre de patients atteints de COVID-19 nécessitant une hospitalisation a révélé que l'utilisation d'un traitement par hydroxychloroquine ou de la chloroquine (avec ou sans macrolide) n'était associée à aucune preuve de bénéfice, mais était plutôt associée à une augmentation du risque d'arythmies ventriculaires et un risque accru de décès à l'hôpital avec COVID-19
Le risque de décès durant l'hospitalisation avec les traitements testés passe de 9% à 16% minimum et même 24% si association de l'hydroxychloroquine avec l'azithromycine.
Cette étude a fait couler beaucoup d'encre et suscité des critiques des défenseurs du protocole du Pr Raoult, dont une nous vient du Maroc. Source Bibliovid

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COVID-19 : Mesures de prévention et contrôle des infections pour l’utilisation des climatiseurs mobiles et des ventilateurs sur pied en milieux de soins dans un contexte de COVID-19

Durant la saison estivale, il est possible de faire face à des vagues de chaleur extrême.
Dans le contexte de la pandémie de COVID-19, il est nécessaire de se positionner sur les mesures de prévention et contrôle des infections requises lors de l’utilisation des climatiseurs mobiles et des ventilateurs sur pied dans les différents milieux de soins.
L'institut national de santé publique du Québec (INSPQ) a émis un avis sur l'utilisation des appareils mobiles de climatisation et des ventilateurs sur pied dans les différents milieux de soins.
Les principes directeurs émis dans ce document ne s’appliquent pas aux systèmes de ventilation et de climatisation centraux permanents des différentes installations,  présentant un risque en raison de la possibilité de dispersion de microorganismes en suspension dans l’air, de débris et de poussières..

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COVID-19 related neuroimaging findings: A signal of thromboembolic complications and a strong prognostic marker of poor patient outcome

L'incidence d'AVC aiguë parmi les patients Covid-19 hospitalisés était de 1.1%. Cette dernière telle que déterminée par les résultats de la neuroimagerie est inférieure à 2,8% d'incidence trouvée chez les patients admis aux Urgences.
La découverte d'un accident vasculaire cérébral aigu par neuroimagerie est un marqueur pronostique fort de mauvais résultats.
Par ailleurs, il est important de signaler qu'il existe une utilisation restreinte de la neuroimagerie chez les patients COVID-19 en raison de multiples contraintes logistiques, y compris la gravité de leur maladie et le souci de propagation de l'infection.

J Neurol Sci
Jain R et al
Source Bibliovid

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Ressources Bibliographiques

ASM : American Society of Microbiology.
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.



The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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18 Mai 2020

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Prise en charge des patients atteints de cancer dans le cadre de la pandémie COVID-19
Dr Imen Gargouri

Le confinement imposé comme mesure préventive, parmi d’autres au cours de la pandémie de coronavirus, n’était pas applicable aux patients ayant des affections chroniques comme le cancer broncho-pulmonaire (CBP) nécessitant une attention particulière.
Ces patients sont connus pour être plus fragiles vis-à-vis des infections virales parce qu’ils sont très souvent atteints d’autres comorbidités (BPCO, insuffisance respiratoire chronique, cardiopathies, diabète) en plus des traitements complexes : chimiothérapie, radiothérapie et une chirurgie.
Le risque de développer des formes sévères et léthales au virus était plus élevé chez les patients âgés et ceux traités par une chirurgie ou une chimiothérapie dans le mois précédent de l’infection.  ...

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Webinaire sur l'infection à coronavirus COVID-19
Le Samedi 16 mai 2020 à 14h

La STMRA a le plaisir de vous inviter à visionner le webinaire organisé sur les aspects immuno-pathologiques de l'infection à coronavirus SARS-Cov2 et l'imagerie :
1. Immunopathologie de l'infection COVID. Pr Hechmi Louzir
2. Imagerie de la pneumonie Covid-19 : indications, aspects et limites . Pr Saoussen Hantous.

Visionner le webinaire »

Le prochain webinaire est programmé le 6 juin 2020 à partir de 16h, avec pour thèmes : l'infection COVID chez l'enfant et la prise en charge thérapeutique de l'infection : état des lieux et pistes futures.
Les conférences seront assurées respectivement par Dr Nadia Nathan de l'hôpital Trousseau de Paris et Dr Loic Kassegne de l'hôpital de Strasbourg

COVID-19 : quelles stratégies de lutte contre l’épidémie ? 

Comment maîtriser le développement d’une épidémie majeure qui touche désormais tous les continents ? COVID-19 met les sociétés et les gouvernements à l’épreuve. Contre cette maladie d’origine virale, aucun vaccin, aucun médicament n’est encore disponible.
Face à ce virus émergent, aucune personne n’était immunisée, et il est difficile d’estimer combien de temps les personnes qui l’ont contracté seront immunisées.
Quelle stratégie choisir pour protéger les populations, maîtriser l’expansion du virus, s’ajuster aux capacités des systèmes de santé, et limiter les impacts sur l’activité des sociétés ? Analyse de deux stratégies : l’atténuation et la suppression. .

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Estimer le fardeau de l'infection COVID en France
Henrik Salje et al.
Science 13 May 2020

La France a été fortement touchée par l'épidémie de SRAS-CoV-2 et est entrée en confinement le 17 mars 2020. En utilisant des modèles appliqués aux données hospitalières et de décès, nous estimons l'impact du confinement et de l'immunité actuelle de la population.
Nous constatons que 3,6% des personnes infectées sont hospitalisées et 0,7% meurent, allant de 0,001% chez les <20 ans à 10,1% chez les > 80 ans.
À tous les âges, les hommes sont plus susceptibles d'être hospitalisés, d'entrer en soins intensifs et de mourir que les femmes. Le confinement a réduit le R0 de 2,90 à 0,67 (réduction de 77%). D'ici le 11 mai 2020, lorsque les interventions devraient être assouplies, nous prévoyons que 2,8 millions (fourchette: 1,8–4,7) de personnes, soit 4,4% (fourchette: 2,8–7,2) de la population, auront été infectées. L'immunité de la population semble insuffisante pour éviter une deuxième vague.

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Revue de la littérature

Covid-19 : Essai Discovery, point d'étape au 7 mai 2020

Au 7 mai 2020, 742 patients sont inclus dans l'essai Discovery, essentiellement en France.
Discovery est un essai thérapeutique promu par l’Inserm, fils de l'essai SOLIDARITY, conduit sous l'égide de l'OMS en Europe et dans le monde. L'investigatrice principale de l’étude, Florence Ader (Hospices civils de Lyon) fait le point sur l’avancement de l’essai et sur sa mise en place à l’échelle européenne.
L’essai Discovery évalue l’efficacité de différents traitements antiviraux visant à limiter la multiplication du virus observée chez certains patients hospitalisés dont l’état s’aggrave, souvent autour du septième jour de maladie. Discovery a pour objectif d’évaluer l’efficacité et la sécurité de différentes stratégies thérapeutiques expérimentales qui, en l’état actuel des connaissances scientifiques, ont été identifiées comme des candidats thérapeutiques potentiels contre le Covid-19.

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Immunité et COVID-19

Le système immunitaire a pour vocation principale la défense contre les infections.
Cette finalité est à la base de l'utilisation des vaccins. Néanmoins, de façon malheureuse, l’immunité peut avoir des effets délétères de façon spontanée, comme dans le cas des maladies auto-immunes, ou secondairement à certains traitements et même lorsqu’il déploie des mécanismes de défense incontrôlés vis-à-vis d’une maladie infectieuse.
Le système immunitaire joue, à l'évidence, un rôle essentiel dans la défense contre les Coronavirus dont, en particulier, le SARS-CoV2 (COVID-19). Celle-ci met en jeu à la fois l’immunité innée et l’immunité adaptative.
Un enjeu essentiel est de comprendre la place respective de l’immunité innée et de l’immunité adaptative dans le développement soit d’une réponse adéquatement contrôlée et efficace, pour à la fois éliminer le virus et générer une immunité protectrice vis-à-vis du pathogène soit d’une réponse incontrôlée où l’activation dérégulée des populations lymphocytaires et la libération massive de cytokines aboutit à la lésion irréversible de l’organe cible, le poumon, avec les conséquences vitales que l’on connait.

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Mutations de la protéine Spike du SARS-Cov2 révélant l'émergence d'une nouvelle souche

La protéine S joue donc un rôle important dans l’infection par le SARS-CoV-2 ainsi que dans l’induction des réponses des anticorps de neutralisation et des cellules T et dans l'immunité protectrice.
Une étude qui vient d'être publiée sur Biorxiv a identifié quatorze mutations de la protéine Spike. Les mutations  peuvent conférer des avantages sélectifs dans la transmission ou la résistance au traitements. 
La mutation Spike D614G constitue une préoccupation urgente ; le virus portant cette mutation a commencé à se répandre en Europe début février, et lors de son introduction dans de nouvelles régions, il devient rapidement la forme dominante.
La protéine S est la “cible de la plupart des stratégies vaccinales et des thérapies à base d'anticorps, la survenue de nouvelles mutations pourrait rendre inefficace les vaccins contre la nouvelle forme du coronavirus.

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Ressources Bibliographiques

ASM : American Society of Microbiology.
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.



The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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