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Tests sérologiques rapides : principes, indications et limites
Pr Meriem MJID

La RT-PCR (reverse-transcription polymerase chain reaction) reste la technique de référence pour le diagnostic biologique du SARS-CoV-2. Toutefois, plusieurs enjeux d’ordre médical, sociétal, organisationnel et de santé publique ont amené au développement de techniques de diagnostic rapide.
En effet, l’OMS recommande actuellement un dépistage de masse de la COVID-19. Toutefois, pour des raisons techniques et logistiques, la capacité de dépistage par la RT-PCR reste limitée.
L'accès à d’autres tests pourrait ainsi faciliter le dépistage de masse, identifier les foyers potentiels de la maladie et suivre le traitement. Les tests de diagnostic rapide (TDR) apparaissent comme une alternative très intéressante dans ces indications. ...

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Webinaire STMRA/SPLF/EFP/SAPLF/SSP
jeudi 25 juin de 18h à 20h

La Société Tunisienne des Maladies Respiratoires et d’Allergologie STMRA organise conjointement avec Société de Pneumologie de Langue Française SPLF, l'Espace Francophone de Pneumologie EFP, La Société Africaine de Pneumologie de Langue Française SAPLF et la Société Suisse de Pneumologie SSP un webinaire intitulé : Regards croisés face à l'infection COVID

Programme :

  1. Tests diagnostiques : que nous disent ils ? comment les utilisons nous ? Pr Leila Slim (Tunis).
  2. Pneumopathie Covid quels supports respiratoires en dehors des soins intensifs ?
  3. Pr Dan Adler (Genève). Données épidémiologiques africaines : impact des antipaludéens ?
  4. Pr Yacouba Toloba (Bamako). Encéphalopathie liée au virus SARS-Cov2 SACRE. Pr Gilles Allali (Genève).

Animation : Dr Frank Soyez (Paris) – Pr Agnès Hamzaoui (Tunis)
Le webinaire se termine par une séance de questions-réponses.

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La coagulopathie dans l'infection COVID 
J Thromb Haemost, Publié le 18 Juin 2020
Toshiaki Iba et al.

D'après des rapports récents, les patients les plus gravement graves présentant une coagulopathie et une formation massive de caillots intravasculaires de type coagulation intravasculaire disséminée (CIVD) sont fréquemment observés dans cette cohorte. Par conséquent, les tests de coagulation peuvent être considérés comme utiles pour distinguer les cas graves de COVID-19.
La présentation clinique de la coagulopathie associée à COVID-19 est principalement un dysfonctionnement organique, tandis que les événements hémorragiques sont moins fréquents.
Les changements dans les biomarqueurs hémostatiques représentés par l'augmentation des D-dimères et des produits de dégradation de la fibrine / fibrinogène.
En comparaison avec la CIVD associée à une septicémie bactérienne, la prolongation du temps de prothrombine et le temps de thromboplastine partielle activée et la diminution de l'activité antithrombine sont moins fréquentes et la thrombocytopénie est relativement rare dans COVID-19.
Les mécanismes de la coagulopathie ne sont cependant pas entièrement élucidés. On suppose que les réponses immunitaires dérégulées orchestrées par des cytokines inflammatoires, la mort cellulaire des lymphocytes, l'hypoxie et les dommages endothéliaux sont impliquées ...

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Sévérité du COVID-19 et diabète sucré: il y a encore beaucoup à apprendre.

Arch Endocrinol Metab - Publié le 11 juin
Rodacki, Melanie.

Le diabète a également été associé à une augmentation de la gravité des infections bactériennes et virales, y compris la grippe H1N1. Cependant, COVID-19 a été associé principalement au diabète type 2 et, à ce jour, pas d'augmentation de la fréquence des cas graves de COVID-19 chez les enfants, les adolescents et les jeunes patients atteints de diabète de type 1.

Le rôle potentiel de l'obésité et du syndrome métabolique dans l'association entre le diabète et la gravité de COVID-19 pourrait soulever la question de savoir si l'hyperglycémie elle-même aurait une influence sur les résultats des patients atteints de COVID-19. Les preuves indiquent que l'hyperglycémie aggrave le pronostic et augmente le risque de décès, en particulier l'hyperglycémie à l'admission à l'hôpital.
L'hyperglycémie aiguë augmente la production de médiateurs inflammatoires qui pourraient potentialiser la «tempête de cytokines» observée dans les cas graves de COVID-19. Bien que de nouvelles informations soient ajoutées quotidiennement aux connaissances actuelles sur l'association entre le diabète et le COVID-19, il reste encore un long chemin à parcourir afin de réduire la fréquence des graves COVID-19 et des décès chez les sujets diabétiques (en particulier dans le Type 2), jusqu'à ce que le vaccin et les options de traitement soient disponibles pour une utilisation clinique.

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Innovation dans la prestation des soins contre le cancer à l'ère de COVID-19 
Journal of Oncology .  publié en ligne le 17 juin 2020
Auteurs : Samyukta Mullangi et al.

Du jour au lendemain, la pandémie de COVID-19 a bouleversé les façons habituelles dont les soins de santé sont pratiqués et dispensés.
Alors qu'autrefois notre écosystème de soins de santé reposait sur une doctrine de capacité et de débit élevés, le risque de contagion et de propagation est désormais si élevé que les prestataires et les patients cherchent tous les deux à minimiser autant que possible les points de contact avec le système de santé.
Le COVID-19 a affecté négativement les soins contre le cancer à bien des égards, mettant les patients et les professionnels de la santé à risque au cours d'un parcours de traitement déjà stressant.
De nombreux fournisseurs de soins anticancéreux ont été tenus de limiter les visites de nouveaux patients, de suspendre tous les essais cliniques et de retarder les soins cliniques non urgents. Cependant, la doublure argentée de la crise est que les incitations établies de force par COVID-19 peuvent conduire à des soins de plus grande valeur et plus centrés sur le patient.
nous espérons qu'au moins les changements axés sur le patient que nous assistons dans le secteur de la prestation peuvent durer.

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Combinaison des tests sérologiques à anticorps totaux et du test RT-PCR pour la détection des infections au SRAS-CoV-2.
J Virol Methods, publié le 15 Juin 2020
Auteur : PeiWang

Le but de cette étude était d'étudier la faisabilité des tests sérologiques à anticorps totaux combinés à la RT-PCR pour la détection du SRAS-COV-2.
Il s'agit d'une étude rétrospective dans laquelle 375 patients ont été recrutés lors de l'épidémie de SRAS-COV-2.
Les résultats ont indiqué que la sensibilité et la spécificité diagnostiques étaient de 95,7% et 98,7%, 92,2% et 100% selon les tests d'anticorps totaux et la RT-PCR, respectivement. La sensibilité et la spécificité des tests d'anticorps totaux combinés à la RT-PCR étaient de 98,6% et 98,7%.
La sensibilité de la méthode combinée était significativement plus élevée que la RT-PCR (X2 = 5,16, P <0,05) et similaire à celle des tests d'anticorps total (X2 = 1,15, P> 0,05).
Cette étude a soutenu l'avantage de la méthode combinée de détection du SRAS-COV-2 avec un degré élevé de sensibilité et de spécificité, en tant qu'outil utile pour un diagnostic précis et un traitement rapide des patients suspects, une enquête épidémiologique, ainsi que la surveillance des épidémies de infections par le SRAS-COV-2.

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Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure   
NEJM. Publié le 17 Juin 2020 - Ellinghaus D et al

Objectifs : Identifier les facteurs génétiques potentiellement impliqués dans le développement et l'évolution du COVID-19 Méthodes  :

  • Etude d'association pangénomique
  • Inclusion de 1980 patients atteints du COVID-19 dans une forme sévère (définie comme une insuffisance respiratoire) dans sept hôpitaux des épicentres italien et espagnol de la pandémie de SARS-CoV-2 en Europe
  • Analyse qualité et exclusion des valeurs aberrantes de la population conduisant à l'inclusion de 835 patients et 1255 participants témoins en Italie ainsi que 775 patients participants et 950 témoins en Espagne
  • Au total, 8 582 968 de polymorphismes mononucléotidiques ont été analysés par une méta-analyse à effet fixe. Pour tenir compte de l'incertitude de l'imputation (test des associations phénotypiques avec les données de dosage des allèles séparément pour les panels cas-témoins italien et espagnol via une régression logistique PLINK avec ajustement et stratification notamment sur le sexe et l'âge). Le seuil de signification statistique a été fixée a 5x10^-8.

Cette étude a permis l'identification d'un groupe de gènes 3p21.31 comme locus de susceptibilité génétique chez les patients atteints de COVID-19 avec insuffisance respiratoire. Elle a également confirmé une implication potentielle du système des groupes sanguins ABO.

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Ressources Bibliographiques

COVIDORG : L'annuaire des documents pratiques Covid-19 pour les professionnels
ASM : American Society of Microbiology
..
BMJ : The British Medical Journal.
Cambridge Univesity Press.
CDC : Centers for Disease Control and Prevention.
Cell Press.
JAMA.
Lancet.




The New England Journal of Médicine.
Oxford University Press.
PLOS.
Springer Nature.
Taylor & Francis.
Web of Science.
WHO : The World Health Organization.
Wiley.

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